1999 yılında İstanbul Tıp Fakültesi’nden mezun olduktan sonra aynı yıl tıpta uzmanlık sınavında ilk 10 içerisine girerek Siyami Ersek Hastanesi Kardiyoloji bölümünde ihtisasına başladı. 2003 yılında aynı hastanede kardiyoloji uzmanı olan Prof. Dr. Ahmet Taha Alper, 2008 yılında Doçent, 2017 yılında ise Profesör unvanını almıştır. Bu süreç zarfında yurt dışında birçok hastanede eğitimlere katılan Prof. Dr. Ahmet Taha Alper’in uluslararası düzeyde 100’ün üzerinde makalesi bulunmaktadır.

2019 yılında Sağlık Bilimleri Üniversitesi İç Hastalıkları Kongresinde EKG kurs direktörlüğü görevini yürütmüş, birçok kardiyoloji kongresine davetli konuşmacı olarak katılmış ve alanında 50’den fazla sunum yapmıştır. 2020 yılında Uluslararası Medicress Good Medical Research kongresini düzenlemiş ve kardiyoloji board başkanlığını yapmıştır.

Koruyucu ve sürdürülebilir sağlık konularında da çalışmalar yürüten Prof. Dr. Ahmet Taha Alper, 2020 yılında Destek Yayınevi’nden çıkan “Kalpleri Ayarlama Enstitüsü” kitabının yazarlarından birisidir.